Le mercredi 13 décembre 2023, à 16 h 30, Jean-Simon Desgagnés a quitté le pavillon Vandry de l’Université Laval, à Québec, après une journée de stage en obstétrique et en gynécologie. Une heure plus tard, il s’asseyait dans un train en direction de Montréal, pour rejoindre ses collègues athlètes qui participaient à un « laboratoire » organisé par le Comité olympique canadien en vue des Jeux de Paris.